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ncbi怎么做blast-blast-ncbi

时间:2024-02-21 手机版
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2. Blastp:是使用蛋白质序列与蛋白质数据库中序列进行比对。作用:可以寻找较远源地序列; 3. Blastx:将给定的核酸序列按照六种框架将其翻译成蛋

BLAST数据库分为两类,核酸数据库和氨基酸数据库,可以用makeblastbd创建。可以用help参数简单看下说明。 $ makeblastdb -help USAGE makeblastdb [-h]

NCBI 线 BLAST 使用方法与结果详解 BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库 DNA BLAST 数据库中进行相似性比较的分析工具

回答:PSI-BLAST的特色是每次用profile搜索数据库后再利用搜索的结果重新构建profile,然后用新的profile再次搜索数据库,如此反复直至没有新的结果产生

blastn是将给定的核酸序列与核酸数据库中的序列进行比较; Blastp是使用蛋白质序列与蛋白质数据库中的序列进行比较,可以寻找较远的系; Blastx将给定

 
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